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在员工与公司之间存在债务纠纷时，需要根据具体情况采取相应的处理措施。这种债务纠纷可能是因为工资、福利待遇、补偿金等方面的问题导致的，也可能是因为员工在工作中损坏了公司的财产或者违反了合同规定所引发的。  

首先，对于工资、福利待遇等方面的债务纠纷，企业应该尽快核实员工的要求是否合法，并及时支付相关款项。同时，企业可以通过协商或者调解的方式与员工进行沟通，寻求双方都可以接受的解决办法。如果经过多次沟通后仍无法达成一致，企业和员工可以通过劳动争议调解委员会或者法院等方式解决纠纷。  

其次，在员工损坏公司财产等方面引起的债务纠纷中，企业需要及时采取有效措施解决问题。如可以要求员工进行赔偿或者扣除部分工资进行赔偿，也可以通过调解等方式解决纠纷。如果员工不愿意履行赔偿义务，企业可以向劳动争议调解委员会或者法院提起诉讼，通过法律手段解决纠纷。  

此外，在处理债务纠纷时，企业需要注意保护员工的合法权益，不能侵犯员工的人格尊严或者进行不当的惩罚。如果企业违反了相关规定，将会承担相应的法律责任。  

最后，为了避免发生债务纠纷，企业可以在日常经营管理中加强内部控制和管理，建立完善的制度和规章制度，明确员工权利和义务，防范类似问题的发生。同时，在签订劳动合同时，也要注重合同的具体条款，以避免因条款不清、不合理而引发纠纷。  

总之，在处理员工与公司之间的债务纠纷时，需要根据具体情况采取相应的措施，保护双方的合法权益，遵守相关法律法规。只有这样，才能真正实现企业和员工之间共同发展的目标。